Die Katholische Jugendfürsorge der Diözese Augsburg e.V. ist ein Verein. An der Spitze des Vereins steht der Vorstand. Zur Zeit ist der Vorsitzende des Vorstands Domvikar Armin Zürn, seine Stellvertreter sind Markus Mayer und Dr. Bernhard Hoch.

Als Kontrollorgan ist der Aufsichtsrat tätig, Vorsitzender des Aufsichtsrats ist Weihbischof em. Josef Grünwald.

Die Vorsitzenden von Vorstand und Aufsichtsrat werden vom Diözesanbischof ernannt.

Das Qualitätsmanagementsystem des Gesamtverbandes ist zertifiziert nach DIN EN ISO 9001:2008.